This alignment was generated with CLUSTALW. Please read about how it was constructed to determine if it suit your needs.
CLUSTAL W (1.74) multiple sequence alignment
ONCO_MOUSE --SITDILSADDIAAALQECQDPDTFEPQKFFQTSGLSKMSASQLKDIFQFIDNDQSGYL
ONCO_RAT --SITDILSAEDIAAALQECQDPDTFEPQKFFQTSGLSKMSASQVKDIFRFIDNDQSGYL
ONCO_HUMAN --SITDVLSADDIAAALQECQDPDTFEPQKFFQTSGLSKMSANQVKDVFRFIDNDQSGYL
PRVU_CHICK -MSLTDILSPSDIAAALRDCQAPDSFSPKKFFQISGMSKKSSSQLKEIFRILDNDQSGFI
PRVA_RAJCL SSKITSILNPADITKALEQCAA--GFHHTAFFKASGLSKKSDAELAEIFNVLDGDQSGYI
PRVB_MERBI --AFSGILADADVAAALKACEAADSFNYKAFFAKVGLTAKSADDIKKAFFVIDQDKSGFI
PRVB_MERMR --AFAGILADADACAAVKACEAADSFSYKAFFAKCGLSGKSADDIKKAFVFIDQDKSGFI
PRVA_CYPCA --AYGGILNDADITAALEACXAXDSFNAKSFFAKVGLSAKTPDDIKKAFAVIDQDKSGFI
PRV2_SALSA --SFAG-LNDADVAAALARCTAADSFNHKAFFAKVGLASKSSDDVKKAFYVIDQDKSGFI
PRVB_ESOLU --SFAG-LKDADVAAALAACSAADSFKHKEFFAKVGLASKSLDDVKKAFYVIDQDKSGFI
PRVB_OPSTA --SFAGILSDADIDAALAACQAAESFKHKEFFAKVGLSAKTPDVIKKAFYVIDQDKSGFI
PRV1_SALSA -MACAHLCKEADIKTALEACKAADTFSFKTFFHTIGFASKSADDVKKAFKVIDQDASGFI
PRVB_LEUCE ----AFGLKEADITAALEACKAADSFNHKAFFAKVGMSAKSAGDVKKAFEIIDEDKSGFI
PRVB_CYPCA --AFAGVLNDADIAAALEACKAADSFNHKAFFAKVGLTSKSADDVKKAFAIIDQDKSGFI
PRVB_GADCA --AFKGILSNADIKAAEAACFKEGSFDEDGFYAKVGLDAFSADELKKLFKIADEDKEGFI
PRVB_MERME --AFAGILADADITAALAACKAEGSFKHGEFFTKIGLKGKSAADIKKVFGIIDQDKSDFV
PRVB_BOACO --AFAGILSDADIAAGLQSCQAADSFSCKTFFAKSGLHSKSKDQLTKVFGVIDRDKSGYI
PRVB_XENLA --AFGGILSEADISAALQNCQAADSFNFKTFFAQSGLSSKSADDVKNVFAILDQDRSGFI
PRVB_GRAGE --AMTDILSAKDIEAALTSCQAADSFNYKSFFSKVGLKGKSTDQVKKIFGILDQDKSGFI
PRVT_CHICK --AITDILSAKDIESALSSCQAADSFNYKSFFSTVGLSSKTPDQIKKVFGILDQDKSGFI
PRVB_AMPME --AITDILSAKDIEAALSSVKAAESFNYKTFFTKCGLAGKPTDQVKKVFDILDQDKSGYI
PRVB_RANES --SITDIVSEKDIDAALESVKAAGSFNYKIFFQKVGLAGKSAADAKKVFEILDRDKSGFI
PRVB_LATCH --AVAKLLAAADVTAALEGCKADDSFNHKVFFQKTGLAKKSNEELEAIFKILDQDKSGFI
PRVA_GERSP --SMTDLLSAEDIKKAIGAFAAADSFDHKKFFQMVGLKKKTPDDVKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_MOUSE --SMTDVLSAEDIKKAIGAFAAADSFDHKKFFQMVGLKKKNPDEVKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_RAT --SMTDLLSAEDIKKAIGAFTAADSFDHKKFFQMVGLKKKSADDVKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_HUMAN --SMTDLLNAEDIKKAVGAFSATDSFDHKKFFQMVGLKKKSADDVKKVFHMLDKDKSGFI
PRVA_MACFU --SMTDLLNAEDIKKAVGAFSAIDSFDHKKFFQMVGLKKKSADDVKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_RABIT --AMTELLNAEDIKKAIGAFAAAESFDHKKFFQMVGLKKKSTEDVKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_FELCA --SMTDLLGAEDIKKAVEAFTAVDSFDYKKFFQMVGLKKKSPDDIKKVFHILDKDKSGFI
PRVA_CAVPO ------LLNAEDIKKAVGACAAAESFDHKKFFQMVGLKKKNREEVKMVFQILDKDKSGFI
PRVM_CHICK --AMTDVLSAEDIKKAVGAFSAAESFNYKKFFEMVGLKKKSPEDVKKVFHILDKDRSGFI
PRVA_RANCA -MHMTDVLPAGDISKAVEAFAAPDSFNHKKFFEMCGLKSKGPDVMKQVFGILDQDRSGFI
PRVA_RANES --PMTDLLAAGDISKAVSAFAAPESFNHKKFFELCGLKSKSKEIMQKVFHVLDQDQSGFI
PRVA_TRISE --PMTKVLKADDINKAISAFKDPGTFDYKRFFHLVGLKGKTDAQVKEVFEILDKDQSGFI
PRVM_SCYCA --PMTKVLNAADISKALNAFEAPGSFDHKKFFQLVGLKGKTHEQVKKVFNIL--------
PRVA_AMPME --SMTDVIPEADINKAIHAFKAGEAFDFKKFVHLLGLNKRSPADVTKAFHILDKDRSGYI
PRVA_LATCH TKKMSEILKAEDIDKALNTFKEAGSFDHHKFFNLVGLKGKPDDTLKEVFGILDQDKSGYI
PRVA_ESOLU ---AKDLLKADDIKKALDAVKAEGSFNHKKFFALVGLKAMSANDVKKVFKAIDADASGFI
* . * * *: *
ONCO_MOUSE DEDELKYFLQRFQSDARELTESETKSLMDAADNDGDGKIGADEFQEMVHS-----
ONCO_RAT DGDELKYFLQKFQSDARELTESETKSLMDAADNDGDGKIGADEFQEMVHS-----
ONCO_HUMAN DEEELKFFLQKFESGARELTESETKSLMAAADNDGDGKIGAEEFQEMVHS-----
PRVU_CHICK EEDELKYFLQRFECGARVLTASETKTFLAAADHDGDGKIGAEEFQEMVQS-----
PRVA_RAJCL EVEELKNFLKCFSDGARVLNDKETSNFLAAGDSDGDHKIGVDEFKSMAKMT----
PRVB_MERBI EEDELKLFLQVFSAGARALTDAETKAFLKAGDSDGDGAIGVDEWAALVKA-----
PRVB_MERMR EEDELKLFLQVFKAGARALTDAETKAFLKAGDSDGDGAIGVEEWVALVKA-----
PRVA_CYPCA EEDELKLFLQNFSAGARALTDAETKAFLKAGDSDGDGKIGVDEFAALVKA-----
PRV2_SALSA EEDELKLFLQNFSASARALTDAETKAFLADGDKDGDGMIGVDEFAAMIKDK----
PRVB_ESOLU EEDELKLFLQNFSPSARALTDAETKAFLADGDKDGDGMIGVDEFAAMIKA-----
PRVB_OPSTA EEDELKLFLQNFASSARALTDKETETFLKAGDSDGDGKIGIDEFADLVKEA----
PRV1_SALSA EVEELKLFLQNFCPKARELTDAETKAFLKAGDADGDGMIGIDEFAVLVKQ-----
PRVB_LEUCE EEEELKLFLQNFKAGARALTDAETKIFLKAGDADGDGKIGIDEFAALVKA-----
PRVB_CYPCA EEDELKLFLQNFKADARALTDGETKTFLKAGDSDGDGKIGVDEFTALVKA-----
PRVB_GADCA EEDELKLFLIAFAADLRALTDAETKAFLKAGDSDGDGKIGVDEFGALVDKWGAKG
PRVB_MERME EEDELKLFLQNFSAGARALTDAETATFLKAGDSDGDGKIGVEEFAAMV-----KG
PRVB_BOACO EEDELKKFLQNFDGKARDLTDKETAEFLKEGDTDGDGKIGVEEFVVLVTKG----
PRVB_XENLA EEEELKLFLQNFSASARALTDAETKAFLAAGDSDGDGKIGVEEFQSLVKP-----
PRVB_GRAGE EEDELQLFLQNFSSTARALTAAETKAFMAAGDTDGDGKIGVDEFQALVKA-----
PRVT_CHICK EEEELQLFLKNFSSSARVLTSAETKAFLAAGDTDGDGKIGVEEFQSLVKA-----
PRVB_AMPME EEDELQLFLKNFCSSARSLSNAETKAFLFAGDSDGDGKIGVDEFQALVRS-----
PRVB_RANES EQDELGLFLQNFRASARVLSDAETSAFLKAGDSDGDGKIGVEEFQALVKA-----
PRVB_LATCH EDEELELFLQNFSAGARTLTKTETETFLKAGDSDGDGKIGVDEFQKLVKA-----
PRVA_GERSP EEDELGFILKGFSSDARDLSAKETKTLLAAGDKDGDGKIGVEEFSTLVSES----
PRVA_MOUSE EEDELGSILKGFSSDARDLSAKETKTLLAAGDKDGDGKIGVEEFSTLVAET----
PRVA_RAT EEDELGSILKGFSSDARDLSAKETKTLMAAGDKDGDGKIGVEEFSTLVAES----
PRVA_HUMAN EEDELGFILKGFSPDARDLSAKETKMLMAAGDKDGDGKIGVDEFSTLVAES----
PRVA_MACFU EEDELGFILKGFSPDARDLSAKETKTLMAAGDKDGDGKIGVDEFSTLVAES----
PRVA_RABIT EEEELGFILKGFSPDARDLSVKETKTLMAAGDKDGDGKIGADEFSTLVSES----
PRVA_FELCA EEDELGFILKGFYPDARDLSVKETKMLMAAGDKDGDGKIDVDEFFSLVAKS----
PRVA_CAVPO EEEELKFILKGFSADARDLSDTETKRMMAAGDKDGDGKIGA--------------
PRVM_CHICK EEEELKFVLKGFTPDGRDLSDKETKALLAAGDKDGDGKIGADEFATMVAES----
PRVA_RANCA EEDELCLMLKGFTPNARSLSVKETTALLAAGDKDGDGKIGMDEFVTLVSES----
PRVA_RANES EKEELCLILKGFTPEGRSLSDKETTALLAAGDKDGDGKIGVDEFVTLVSES----
PRVA_TRISE EEEELKGVLKGFSAHGRDLNDTETKALLAAGDSDHDGKIGADEFAKMVAQA----
PRVM_SCYCA -------------------------------------------------------
PRVA_AMPME EEEELQLILKGFSKEGRELTDKETKDLLIKGDKDGDGKIGVDEFTSLVAES----
PRVA_LATCH EEEELKFVLKGFAAGGRELTANETKALLKAGDQDGDDKIGVDEFTNLVKAA----
PRVA_ESOLU EEEELKFVLKSFAADGRDLTDAETKAFLKAADKDGDGKIGIDEFETLVHEA----
Protein Codes: ONCO = oncomodulin (mammalian beta lineage parvalbumin); PRVA = parvalbumin, alpha lineage; PRVB = parvalbumin, beta lineage; PRVM = parvalbumin, muscle; PRVT = avian thymic hormone (thymic parvalbumin); PRVU = parvalbumin 3; PRV1 = parvalbumin, beta lineage, isoform 1; PRV2 = parvalbumin, beta lineage, isoform 2
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
CaBP Data Library Home
Page|
General Info|
Sequence Info|
Structural Info|
Analysis Tools
Top of Current Section|
Search the Data Library|
Site Map|
Feedback