AMBER Archive (2007)

Subject: AMBER: Error - must define AMBERHOME environment variable

From: bertrand russell (betrussell23_at_gmail.com)
Date: Fri Mar 23 2007 - 14:05:47 CST

Dear Amber9 users,

I am trying to compile amber9 in my HP-work station xw4200 running in
FC3.Ihope that I following all the instructions properly during my
installation
procedure. But, if run

> make test.serial I am getting the following error.

##########################################################################################################################################

ptraj: test ptraj on averaging les trajectory to normal trajectory
diffing hef_averaged.crd.save with hef_averaged.crd
PASSED
==============================================================
cd leap; ./Run.tleap
Error - must define AMBERHOME environment variable
make: *** [test.leap] Error 1
[root_at_electron test]#

##########################################################################################################################################

 But I am sure that I set the AMBERHOME environment variable corrrectly.
When I issue

##########################################################################################################################################
ptraj: test ptraj on averaging les trajectory to normal trajectory
diffing hef_averaged.crd.save with hef_averaged.crd
PASSED
==============================================================
cd leap; ./Run.tleap
Error - must define AMBERHOME environment variable
make: *** [test.leap] Error 1
[root_at_electron test]# echo $AMBERHOME
/usr/local/insprogrms/amber/amber9
[root_at_electron test]#
##########################################################################################################################################

My path is as follows,

##########################################################################################################################################

ptraj: test ptraj on averaging les trajectory to normal trajectory
diffing hef_averaged.crd.save with hef_averaged.crd
PASSED
==============================================================
cd leap; ./Run.tleap
Error - must define AMBERHOME environment variable
make: *** [test.leap] Error 1
[root_at_electron test]# echo $AMBERHOME
/usr/local/insprogrms/amber/amber9
[root_at_electron test]# echo $PATH
/usr/kerberos/sbin:/usr/kerberos/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/X11R6/bin:/root/bin:/usr/local/insprogrms/amber/amber9/exe

##########################################################################################################################################

I don't know what I am doing wrong? Could anyone tell me, why I am getting
this error even when I have exported the AMBERHOME variable correctly. I am
compiling with g95 and I couldn't notice any error while compiling or while
making.
Many thanks in advance. 

-- 
Live Life; Don't pass it
Bertrand.P.S.Russell
+91-9894398441

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