AMBER Archive (2001)

Subject: Re: help

From: Elsa de Sousa Henriques (eshenriq_at_fc.up.pt)
Date: Mon Nov 05 2001 - 11:42:39 CST


seema namboori wrote:
>
> ... I am using AMBER forcefield in
> the GROMACS software.For this,i have got to convert
> the van der Waals potentials to the Lennard-Jones
> (6-12) potetials.I have searched a lot but am unable
> to find the formula to convert van der Waals to 6-12
> potential.
>

Hi!

Check

        http://www.amber.ucsf.edu/amber/Questions/vdw.html

Elsa

-- 
  .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.
 /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\
X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X
 `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-'
	   "There is no gene for the human spirit"
                                    in Gattaca
 .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-. .-.   .-.
X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X|||\ /|||X
 \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/ \|||X|||/
  `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'   `-' `-'
Elsa F. Sousa Henriques             e-mail: eshenriq_at_fc.up.pt
Dept. Quimica, FCUP                  phone: +351-22-6082827
Rua do Campo Alegre, 687               fax: +351-22-6082959
4169-007 PORTO