Starting installation of Amber10 (parallel) at Tue Sep 29 20:51:26 IST 2009.
cd sander; make parallel
make[1]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/sander'
./checkparconf
cd ../lib; make sys.a
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: `sys.a' is up to date.
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lib'
cd ../lib; make nxtsec.o
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: `nxtsec.o' is up to date.
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lib'
cd ../lapack; make
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lapack'
ar rv lapack.a dsyev.o dsygv.o dlansy.o dsytrd.o dorgtr.o dsteqr.o dsterf.o dlascl.o dlamch.o xerbla.o ilaenv.o dlassq.o dsytd2.o dlatrd.o dorgql.o dorgqr.o dlasrt.o dlaset.o dlanst.o dlaev2.o dlasr.o dlapy2.o dlartg.o dlae2.o dorg2r.o dlarft.o dlarfb.o dorg2l.o dlarfg.o dlarf.o dspev.o dlansp.o dsptrd.o dopgtr.o dppsv.o dspsv.o dgeev.o dsptrs.o dsptrf.o dpptrs.o dpptrf.o dgebak.o dtrevc.o dlacpy.o dhseqr.o dorghr.o dgehrd.o dgebal.o dlange.o dlabad.o dlahqr.o dlarfx.o dlanhs.o dlaln2.o dgehd2.o dlahrd.o dlanv2.o dladiv.o dgerq2.o dorm2r.o dlarnv.o dgeqr2.o dlaruv.o dspevd.o dstedc.o dopmtr.o dlaed0.o dlaed1.o dlaed7.o dlaeda.o dlaed8.o dlaed9.o dlamrg.o dlaed2.o dlaed3.o dpotrf.o dsygst.o dpotf2.o dsygs2.o dlaebz.o dlagtf.o dlagts.o dormqr.o dormql.o dorm2l.o dlaed4.o dlaed5.o dlaed6.o ieeeck.o dsyevx.o dsyevd.o dstebz.o dstein.o dormtr.o zheev.o lsame.o zlanhe.o zlascl.o zhetrd.o zungtr.o zsteqr.o zlassq.o zlatrd.o zhetd2.o zungql.o zungqr.o zlasr.o zlaset.o zlacgv.o zlarfg.o zung2l.o zlarft.o zlarfb.o zung2r.o dlapy3.o zladiv.o zlarf.o dgesvd.o dgebrd.o dgebd2.o dlabrd.o dorgbr.o dbdsqr.o dgeqrf.o dormbr.o dgelqf.o dorglq.o dlas2.o dlasq1.o dlasv2.o dgelq2.o dorgl2.o dlasq2.o dormlq.o dlasq3.o dlasq4.o dlasq5.o dorml2.o dlasq6.o dgesv.o dgetrs.o dlaswp.o dgetrf.o dgetf2.o dsysv.o dsytrs.o dsytrf.o dlasyf.o dsytf2.o dgelsd.o dlalsd.o dlasdq.o dlasda.o dlalsa.o dlasd6.o dlals0.o dlasdt.o dlasd7.o dlasd8.o dlasd4.o dlasd5.o dgelsy.o dlaic1.o dtzrzf.o dormrz.o dlarzt.o dlarzb.o dlatrz.o dormr3.o dgeqp3.o dlarz.o dlaqps.o dlaqp2.o dspevx.o dsyevr.o dstegr.o dlarrv.o dlarre.o dlarrb.o dlar1v.o dlarrf.o
r - dsyev.o
r - dsygv.o
r - dlansy.o
r - dsytrd.o
r - dorgtr.o
r - dsteqr.o
r - dsterf.o
r - dlascl.o
r - dlamch.o
r - xerbla.o
r - ilaenv.o
r - dlassq.o
r - dsytd2.o
r - dlatrd.o
r - dorgql.o
r - dorgqr.o
r - dlasrt.o
r - dlaset.o
r - dlanst.o
r - dlaev2.o
r - dlasr.o
r - dlapy2.o
r - dlartg.o
r - dlae2.o
r - dorg2r.o
r - dlarft.o
r - dlarfb.o
r - dorg2l.o
r - dlarfg.o
r - dlarf.o
r - dspev.o
r - dlansp.o
r - dsptrd.o
r - dopgtr.o
r - dppsv.o
r - dspsv.o
r - dgeev.o
r - dsptrs.o
r - dsptrf.o
r - dpptrs.o
r - dpptrf.o
r - dgebak.o
r - dtrevc.o
r - dlacpy.o
r - dhseqr.o
r - dorghr.o
r - dgehrd.o
r - dgebal.o
r - dlange.o
r - dlabad.o
r - dlahqr.o
r - dlarfx.o
r - dlanhs.o
r - dlaln2.o
r - dgehd2.o
r - dlahrd.o
r - dlanv2.o
r - dladiv.o
r - dgerq2.o
r - dorm2r.o
r - dlarnv.o
r - dgeqr2.o
r - dlaruv.o
r - dspevd.o
r - dstedc.o
r - dopmtr.o
r - dlaed0.o
r - dlaed1.o
r - dlaed7.o
r - dlaeda.o
r - dlaed8.o
r - dlaed9.o
r - dlamrg.o
r - dlaed2.o
r - dlaed3.o
r - dpotrf.o
r - dsygst.o
r - dpotf2.o
r - dsygs2.o
r - dlaebz.o
r - dlagtf.o
r - dlagts.o
r - dormqr.o
r - dormql.o
r - dorm2l.o
r - dlaed4.o
r - dlaed5.o
r - dlaed6.o
r - ieeeck.o
r - dsyevx.o
r - dsyevd.o
r - dstebz.o
r - dstein.o
r - dormtr.o
r - zheev.o
r - lsame.o
r - zlanhe.o
r - zlascl.o
r - zhetrd.o
r - zungtr.o
r - zsteqr.o
r - zlassq.o
r - zlatrd.o
r - zhetd2.o
r - zungql.o
r - zungqr.o
r - zlasr.o
r - zlaset.o
r - zlacgv.o
r - zlarfg.o
r - zung2l.o
r - zlarft.o
r - zlarfb.o
r - zung2r.o
r - dlapy3.o
r - zladiv.o
r - zlarf.o
r - dgesvd.o
r - dgebrd.o
r - dgebd2.o
r - dlabrd.o
r - dorgbr.o
r - dbdsqr.o
r - dgeqrf.o
r - dormbr.o
r - dgelqf.o
r - dorglq.o
r - dlas2.o
r - dlasq1.o
r - dlasv2.o
r - dgelq2.o
r - dorgl2.o
r - dlasq2.o
r - dormlq.o
r - dlasq3.o
r - dlasq4.o
r - dlasq5.o
r - dorml2.o
r - dlasq6.o
r - dgesv.o
r - dgetrs.o
r - dlaswp.o
r - dgetrf.o
r - dgetf2.o
r - dsysv.o
r - dsytrs.o
r - dsytrf.o
r - dlasyf.o
r - dsytf2.o
r - dgelsd.o
r - dlalsd.o
r - dlasdq.o
r - dlasda.o
r - dlalsa.o
r - dlasd6.o
r - dlals0.o
r - dlasdt.o
r - dlasd7.o
r - dlasd8.o
r - dlasd4.o
r - dlasd5.o
r - dgelsy.o
r - dlaic1.o
r - dtzrzf.o
r - dormrz.o
r - dlarzt.o
r - dlarzb.o
r - dlatrz.o
r - dormr3.o
r - dgeqp3.o
r - dlarz.o
r - dlaqps.o
r - dlaqp2.o
r - dspevx.o
r - dsyevr.o
r - dstegr.o
r - dlarrv.o
r - dlarre.o
r - dlarrb.o
r - dlar1v.o
r - dlarrf.o
ranlib lapack.a
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lapack'
cd ../blas; make
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/blas'
ar rv blas.a dasum.o daxpy.o dcabs1.o dcopy.o ddot.o dgbmv.o dgemm.o dgemv.o dger.o dnrm2.o drot.o drotg.o dsbmv.o dscal.o dspmv.o dspr.o dspr2.o dswap.o dsymm.o dsymv.o dsyr.o dsyr2.o dsyr2k.o dsyrk.o dtbmv.o dtbsv.o dtpmv.o dtpsv.o dtrmm.o dtrmv.o dtrsm.o dtrsv.o dummy.o dzasum.o dznrm2.o idamax.o isamax.o lsame.o scopy.o sswap.o sscal.o sasum.o snrm2.o sdot.o ssyr2k.o saxpy.o sgemv.o ssyr2.o ssymv.o sgemm.o strmm.o strmv.o sger.o zher2k.o zswap.o zgemv.o zhemv.o zscal.o zdotc.o zaxpy.o zher2.o zdscal.o ztrmv.o zcopy.o ztrmm.o zgemm.o zgerc.o
r - dasum.o
r - daxpy.o
r - dcabs1.o
r - dcopy.o
r - ddot.o
r - dgbmv.o
r - dgemm.o
r - dgemv.o
r - dger.o
r - dnrm2.o
r - drot.o
r - drotg.o
r - dsbmv.o
r - dscal.o
r - dspmv.o
r - dspr.o
r - dspr2.o
r - dswap.o
r - dsymm.o
r - dsymv.o
r - dsyr.o
r - dsyr2.o
r - dsyr2k.o
r - dsyrk.o
r - dtbmv.o
r - dtbsv.o
r - dtpmv.o
r - dtpsv.o
r - dtrmm.o
r - dtrmv.o
r - dtrsm.o
r - dtrsv.o
r - dummy.o
r - dzasum.o
r - dznrm2.o
r - idamax.o
r - isamax.o
r - lsame.o
r - scopy.o
r - sswap.o
r - sscal.o
r - sasum.o
r - snrm2.o
r - sdot.o
r - ssyr2k.o
r - saxpy.o
r - sgemv.o
r - ssyr2.o
r - ssymv.o
r - sgemm.o
r - strmm.o
r - strmv.o
r - sger.o
r - zher2k.o
r - zswap.o
r - zgemv.o
r - zhemv.o
r - zscal.o
r - zdotc.o
r - zaxpy.o
r - zher2.o
r - zdscal.o
r - ztrmv.o
r - zcopy.o
r - ztrmm.o
r - zgemm.o
r - zgerc.o
ranlib blas.a
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/blas'
cd ../lmod; make
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lmod'
cd ../arpack; make; mv arpack.a ../lmod/lmod.a
make[3]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/arpack'
ar rv arpack.a ivout.o dvout.o dgetv0.o dlaqrb.o dnaitr.o dnapps.o dnaup2.o dnaupd.o dnconv.o dneigh.o dmout.o dneupd.o dngets.o dsaitr.o dsapps.o dsaup2.o dsaupd.o dsconv.o dseigt.o dsesrt.o dseupd.o dsgets.o dsortc.o dsortr.o dstatn.o dstats.o dstqrb.o svout.o sgetv0.o slaqrb.o snaitr.o snapps.o snaup2.o snaupd.o snconv.o sneigh.o smout.o sneupd.o sngets.o ssaitr.o ssapps.o ssaup2.o ssaupd.o ssconv.o sseigt.o ssesrt.o sseupd.o ssgets.o ssortc.o ssortr.o sstatn.o sstats.o sstqrb.o
a - ivout.o
a - dvout.o
a - dgetv0.o
a - dlaqrb.o
a - dnaitr.o
a - dnapps.o
a - dnaup2.o
a - dnaupd.o
a - dnconv.o
a - dneigh.o
a - dmout.o
a - dneupd.o
a - dngets.o
a - dsaitr.o
a - dsapps.o
a - dsaup2.o
a - dsaupd.o
a - dsconv.o
a - dseigt.o
a - dsesrt.o
a - dseupd.o
a - dsgets.o
a - dsortc.o
a - dsortr.o
a - dstatn.o
a - dstats.o
a - dstqrb.o
a - svout.o
a - sgetv0.o
a - slaqrb.o
a - snaitr.o
a - snapps.o
a - snaup2.o
a - snaupd.o
a - snconv.o
a - sneigh.o
a - smout.o
a - sneupd.o
a - sngets.o
a - ssaitr.o
a - ssapps.o
a - ssaup2.o
a - ssaupd.o
a - ssconv.o
a - sseigt.o
a - ssesrt.o
a - sseupd.o
a - ssgets.o
a - ssortc.o
a - ssortr.o
a - sstatn.o
a - sstats.o
a - sstqrb.o
ranlib arpack.a
make[3]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/arpack'
cd xmin; make
make[3]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lmod/xmin'
make[3]: Nothing to be done for `install'.
make[3]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lmod/xmin'
cd lmod; make
make[3]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lmod/lmod'
make[3]: Nothing to be done for `install'.
make[3]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lmod/lmod'
ar rv lmod.a xmin/*.o lmod/*.o
a - xmin/libxmin.o
a - xmin/mcsrch.o
a - lmod/arpkdrv.o
a - lmod/liblmod.o
ranlib lmod.a
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lmod'
cd ../lmod; cp lmodprmtop ../../exe; chmod 0755 ../../exe/lmodprmtop
/usr/local/MPICH2/bin/mpif90   -ffree-form  -o sander.MPI  constants.o nose_hoover.o nose_hoover_vars.o nose_hoover_init.o stack.o qmmm_module.o qm2_dftb_module.o trace.o lmod.o decomp.o icosasurf.o egb.o remd.o findmask.o pb_force.o pb_exmol.o pb_mpfrc.o pb_direct.o pb_list.o np_force.o sa_driver.o relax_mat.o nmr.o multisander.o sander.o trajene.o cshf.o nmrcal.o pearsn.o printe.o runmin.o rdparm.o mdread.o locmem.o runmd.o getcor.o degcnt.o decnvh.o fastwt.o parallel.o shake.o ene.o mdwrit.o minrit.o set.o dynlib.o mdfil.o nmlsrc.o ew_force.o ew_setup.o ew_box.o ew_bspline.o ew_fft.o nonbond_list.o short_ene.o ew_recip.o pcshift.o align.o csa.o rfree.o rgroup.o random.o amopen.o debug.o ew_recip_reg.o ew_handle_dips.o ew_dipole_recip.o mexit.o new_time.o extra_pts.o thermo_int.o matinv.o assert.o mmtsb.o mmtsb_client.o erfcfun.o veclib.o is_init.o constantph.o prn_dipoles.o ips.o sglds.o amoeba_valence.o amoeba_multipoles.o amoeba_recip.o amoeba_interface.o amoeba_direct.o amoeba_mdin.o amoeba_adjust.o amoeba_self.o amoeba_vdw.o amoeba_induced.o amoeba_runmd.o  bintraj.o spatial_recip.o spatial_fft.o parms.o softcore.o molecule.o xref.o dssp.o qm_mm.o qm_link_atoms.o qm_ewald.o qm_gb.o qm_zero_charges.o qm_print_info.o qm_assign_atom_types.o qm2_allocate_e_repul.o qm2_calc_charges.o qm2_calc_rij_and_eqns.o qm2_dihed.o qm2_energy.o qm2_fock.o qm2_get_qm_forces.o qm2_get_qmmm_forces.o qm2_h1elec.o qm2_hcore_qmqm.o qm2_hcore_qmmm.o qm2_identify_peptide_links.o qm2_load_params_and_allocate.o qm2_repp.o qm2_rotate_qmqm.o qm2_scf.o qm2_setup_orb_exp.o qm2_smallest_number.o  qm2_dftb_broyden.o qm2_dftb_dispersion_egr.o qm2_dftb_dispersion_params.o qm2_dftb_dispersionread.o qm2_dftb_scf.o qm2_dftb_energy.o qm2_dftb_ewevge.o qm2_dftb_externalshift.o qm2_dftb_fermi.o qm2_dftb_get_qm_forces.o qm2_dftb_gamma.o qm2_dftb_gammamat.o qm2_dftb_get_qmmm_forces.o qm2_dftb_gettab.o qm2_dftb_load_params.o qm2_dftb_mulliken.o qm2_dftb_repulsiv.o qm2_dftb_self.o qm2_dftb_shift.o qm2_dftb_short_range.o qm2_dftb_skpar.o qm2_dftb_slkode.o qm2_dftb_slktrafo.o qm2_dftb_read_cm3.o qm2_dftb_cm3.o qm2_dftb_ewald.o qm2_dftb_gb.o  \
              pimd_vars.o pimd_force.o pimd_init.o cmd_vars.o cmd_matrix.o  lscivr_vars.o lsc_init.o lsc_xp.o evb_vars.o evb_mathf.o evb_init.o evb_bcast.o evb_dealloc.o check_input.o evb_io.o evb_keywrd.o exchange_gauss.o exchange_warshel.o react_flux_init.o react_path.o react_flux.o kappa_keck.o schlegel_dg.o schlegel_full.o schlegel_diis.o schlegel_gmres.o schlegel_gbasis.o schlegel_pgbasis.o bnd_strtch.o ang_bend.o dihed_tors.o torinternal.o evb_gfchk.o bmat_inv.o bmat_grad.o unitv.o crossv.o cart2internal.o wdc_bmat.o select_coord.o schlegel_uff.o schlegel_poh_uff.o schlegel_poh_irc.o schlegel_hcn_cart.o schlegel_hcn_int_irc.o schlegel_hcn_cart_irc.o evb_outoptions.o evb_2stdebug.o egap_umb_2stdebug.o dg_debug.o evb_io_debug.o bmat_debug.o bmat_inv_debug.o evb_io_debug2.o morse_anal2num.o xwarshel_anal2num.o xgauss_anal2num.o vdw_anal2num.o rcdbonds_anal2num.o rcbond_anal2num.o dg_grad_anal2num.o evb_input.o evb_alloc.o evb_matrix.o morsify.o mod_vdw.o evb_ntrfc.o evb_force.o out_evb.o dbonds_anal2num.o bond_anal2num.o evb_umb.o evb_umb_primitive.o qm_div.o force.o \
		../lmod/lmod.a ../lapack/lapack.a ../blas/blas.a \
		../lib/nxtsec.o ../lib/sys.a mt19937.o ncsu-abmd-hooks.o ncsu-bbmd-ctxt.o ncsu-bbmd-hooks.o ncsu-cftree.o ncsu-colvar-math.o ncsu-colvar-type.o ncsu-colvar-utils.o ncsu-colvar.o ncsu-constants.o ncsu-cv-ANGLE.o ncsu-cv-DISTANCE.o ncsu-cv-HANDEDNESS.o ncsu-cv-MULTI_RMSD.o ncsu-cv-N_OF_BONDS.o ncsu-cv-N_OF_STRUCTURES.o ncsu-cv-R_OF_GYRATION.o ncsu-cv-TORSION.o ncsu-lexer.o ncsu-parser.o ncsu-pmd-hooks.o ncsu-rmsd.o ncsu-sander-hooks.o ncsu-sander-proxy.o ncsu-smd-hooks.o ncsu-umbrella.o ncsu-utils.o ncsu-value.o ../netcdf/lib/libnetcdf.a 
/usr/local/MPICH2/bin/mpif90   -ffree-form  -o sander.LES.MPI constants.o nose_hoover.o nose_hoover_vars.o nose_hoover_init_LES.o qmmm_module.o qm2_dftb_module.o trace.o lmod.o decomp.o icosasurf.o egb.LES.o remd.LES.o findmask.o pb_force.o pb_exmol.o pb_mpfrc.o pb_direct.o pb_list.o np_force.o sa_driver.o relax_mat.o nmr.LES.o multisander.LES.o sander.LES.o trajene.o cshf.o nmrcal.o pearsn.o printe.o runmin.o nonbond_list.LES.o force.LES.o rdparm.LES.o mdread.LES.o locmem.LES.o runmd.LES.o getcor.o degcnt.LES.o decnvh.o fastwt.o parallel.LES.o shake.o ene.LES.o mdwrit.o minrit.o set.o dynlib.LES.o mdfil.o nmlsrc.o ew_force.LES.o ew_setup.LES.o ew_box.o ew_bspline.o ew_fft.o short_ene.LES.o ew_recip.LES.o pcshift.o align.o csa.o stack.o rfree.o rgroup.o random.o amopen.o debug.o ew_recip_reg.o ew_handle_dips.o ew_dipole_recip.o mexit.o new_time.o extra_pts.LES.o thermo_int.o matinv.o assert.o mmtsb.o mmtsb_client.o erfcfun.o veclib.o is_init.o constantph.o prn_dipoles.o ips.o sglds.o qm_mm.o qm_link_atoms.o qm_ewald.o qm_gb.o qm_zero_charges.o qm_print_info.o qm_assign_atom_types.o qm2_allocate_e_repul.o qm2_calc_charges.o qm2_calc_rij_and_eqns.o qm2_dihed.o qm2_energy.o qm2_fock.o qm2_get_qm_forces.o qm2_get_qmmm_forces.o qm2_h1elec.o qm2_hcore_qmqm.o qm2_hcore_qmmm.o qm2_identify_peptide_links.o qm2_load_params_and_allocate.o qm2_repp.o qm2_rotate_qmqm.o qm2_scf.o qm2_setup_orb_exp.o qm2_smallest_number.o qm2_dftb_broyden.o qm2_dftb_dispersion_egr.o qm2_dftb_dispersion_params.o qm2_dftb_dispersionread.o qm2_dftb_scf.o qm2_dftb_energy.o qm2_dftb_ewevge.o qm2_dftb_externalshift.o qm2_dftb_fermi.o qm2_dftb_get_qm_forces.o qm2_dftb_gamma.o qm2_dftb_gammamat.o qm2_dftb_get_qmmm_forces.o qm2_dftb_gettab.o qm2_dftb_load_params.o qm2_dftb_mulliken.o qm2_dftb_repulsiv.o qm2_dftb_self.o qm2_dftb_shift.o qm2_dftb_short_range.o qm2_dftb_skpar.o qm2_dftb_slkode.o qm2_dftb_slktrafo.o qm2_dftb_read_cm3.o qm2_dftb_cm3.o qm2_dftb_ewald.o qm2_dftb_gb.o  amoeba_valence.o amoeba_multipoles.o amoeba_recip.o amoeba_interface.o amoeba_direct.o amoeba_mdin.o amoeba_adjust.o amoeba_self.o amoeba_vdw.o amoeba_induced.o amoeba_runmd.o  bintraj.o spatial_recip.o spatial_fft.o parms.o softcore.o molecule.o xref.o dssp.o evb_vars.o evb_mathf.o evb_init.o evb_bcast.o evb_dealloc.o check_input.o evb_io.o evb_keywrd.o exchange_gauss.o exchange_warshel.o react_flux_init.o react_path.o react_flux.o kappa_keck.o schlegel_dg.o schlegel_full.o schlegel_diis.o schlegel_gmres.o schlegel_gbasis.o schlegel_pgbasis.o bnd_strtch.o ang_bend.o dihed_tors.o torinternal.o evb_gfchk.o bmat_inv.o bmat_grad.o unitv.o crossv.o cart2internal.o wdc_bmat.o select_coord.o schlegel_uff.o schlegel_poh_uff.o schlegel_poh_irc.o schlegel_hcn_cart.o schlegel_hcn_int_irc.o schlegel_hcn_cart_irc.o evb_outoptions.o evb_2stdebug.o egap_umb_2stdebug.o dg_debug.o evb_io_debug.o bmat_debug.o bmat_inv_debug.o evb_io_debug2.o morse_anal2num.o xwarshel_anal2num.o xgauss_anal2num.o vdw_anal2num.o rcdbonds_anal2num.o rcbond_anal2num.o dg_grad_anal2num.o evb_input.LES.o evb_alloc.LES.o evb_matrix.LES.o morsify.LES.o mod_vdw.LES.o evb_ntrfc.LES.o evb_force.LES.o evb_pimd_init.LES.o out_evb.LES.o dbonds_anal2num.o bond_anal2num.o evb_umb.LES.o evb_umb_primitive.LES.o pimd_vars.o pimd_force.LES.o pimd_init.LES.o cmd_vars.o cmd_matrix.LES.o lscivr_vars.o lsc_init.o lsc_xp.o \
		../lmod/lmod.a ../lapack/lapack.a ../blas/blas.a \
		../lib/nxtsec.o ../lib/sys.a mt19937.o ncsu-abmd-hooks.o ncsu-bbmd-ctxt.o ncsu-bbmd-hooks.o ncsu-cftree.o ncsu-colvar-math.o ncsu-colvar-type.o ncsu-colvar-utils.o ncsu-colvar.o ncsu-constants.o ncsu-cv-ANGLE.o ncsu-cv-DISTANCE.o ncsu-cv-HANDEDNESS.o ncsu-cv-MULTI_RMSD.o ncsu-cv-N_OF_BONDS.o ncsu-cv-N_OF_STRUCTURES.o ncsu-cv-R_OF_GYRATION.o ncsu-cv-TORSION.o ncsu-lexer.o ncsu-parser.o ncsu-pmd-hooks.o ncsu-rmsd.o ncsu-sander-hooks.o ncsu-sander-proxy.o ncsu-smd-hooks.o ncsu-umbrella.o ncsu-utils.o ncsu-value.o ../netcdf/lib/libnetcdf.a 
/bin/mv sander.MPI sander.LES.MPI ../../exe
make[1]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/sander'
cd addles && make install
make[1]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/addles'
cd ../lib; ./Makelist ../lib/random.o ../lib/mexit.o  ../lib/nxtsec.o
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: `random.o' is up to date.
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: `mexit.o' is up to date.
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: Entering directory `/usr/local/amber10/src/lib'
make[2]: `nxtsec.o' is up to date.
make[2]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/lib'
/usr/local/MPICH2/bin/mpif90     -o addles lesmain.o addspace.o readprm.o writprm.o readcrd.o writcrd.o pick.o  	 rline.o   nxt.o intgr.o   find.o    of.o geti.o    unit.o    getc.o alert.o   echo.o    get4c.o getd.o    wlesprm.o lesprm.o les2prm.o checksz.o addspace_atm1st.o ../lib/random.o ../lib/mexit.o  ../lib/nxtsec.o 
mv addles ../../exe
make[1]: Leaving directory `/usr/local/amber10/src/addles'

Installation of Amber10 (parallel) is complete at Tue Sep 29 20:51:28 IST 2009.