mkdir /usr/local/amber10/bin /usr/local/amber10/lib /usr/local/amber10/include
*** Error code 2 (ignored)
(cd ucpp-1.3 && make install )
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE mem.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE nhash.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE cpp.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE lexer.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE assert.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE macro.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -DSTAND_ALONE eval.c
cc  -o ucpp mem.o nhash.o cpp.o lexer.o assert.o macro.o eval.o 
mv ucpp /usr/local/amber10/bin
(cd byacc && make install )
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o closure.o closure.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o error.o error.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o lalr.o lalr.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o lr0.o lr0.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o main.o main.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o mkpar.o mkpar.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o output.o output.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o reader.o reader.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o skeleton.o skeleton.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o symtab.o symtab.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o verbose.o verbose.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o warshall.o warshall.c
mv yacc /usr/local/amber10/bin
(cd carpack && make install );
ar rv arpack.a dgetv0.o dlaqrb.o dnaitr.o dnapps.o  dnaup2.o dnaupd.o dnconv.o dneigh.o  dneupd.o dngets.o dsaitr.o dsapps.o dsaup2.o  dsaupd.o dsconv.o dseigt.o dsesrt.o dseupd.o  dsgets.o dsortc.o dsortr.o dstatn.o dstats.o dstqrb.o dsarpack.o  wallclock.o dmout.o ivout.o dvout.o
a - dgetv0.o
a - dlaqrb.o
a - dnaitr.o
a - dnapps.o
a - dnaup2.o
a - dnaupd.o
a - dnconv.o
a - dneigh.o
a - dneupd.o
a - dngets.o
a - dsaitr.o
a - dsapps.o
a - dsaup2.o
a - dsaupd.o
a - dsconv.o
a - dseigt.o
a - dsesrt.o
a - dseupd.o
a - dsgets.o
a - dsortc.o
a - dsortr.o
a - dstatn.o
a - dstats.o
a - dstqrb.o
a - dsarpack.o
a - wallclock.o
a - dmout.o
a - ivout.o
a - dvout.o
ranlib arpack.a
mv arpack.a /usr/local/amber10/lib
(cd clapack && make install )
ar rv lapack.a dsyev.o dsyevd.o dormtr.o dormql.o dormqr.o dlansy.o dsytrd.o dorgtr.o dsteqr.o  dsterf.o dlascl.o dlamch.o ilaenv.o dlassq.o dsytd2.o dorm2l.o  dlatrd.o dorgql.o dorgqr.o dlasrt.o dlaset.o dlanst.o dlaev2.o  dlasr.o dlapy2.o dlartg.o dlae2.o dorg2r.o dlarft.o dlarfb.o  dorg2l.o dlarfg.o dlarf.o dspev.o dlansp.o dsptrd.o dopgtr.o  dposv.o dppsv.o dspsv.o dgeev.o dsptrs.o dsptrf.o dpptrs.o dpptrf.o  dgebak.o dtrevc.o dlacpy.o dhseqr.o dorghr.o dgehrd.o dgebal.o  dlange.o dlabad.o dlahqr.o dlarfx.o dlanhs.o dlaln2.o dgehd2.o  dlahrd.o dlanv2.o dladiv.o dgerq2.o dorm2r.o dlarnv.o dgeqr2.o  dlaruv.o dspevd.o dstedc.o dopmtr.o dlaed0.o dlaed1.o dlaed7.o  dlaeda.o dlaed8.o dlaed9.o dlamrg.o dlaed2.o dlaed3.o dsygv.o  dsygst.o dsygs2.o  dlaed4.o dlaed5.o dlaed6.o dpotrf.o dpotrs.o dpotf2.o ieeeck.o  dsyevd.o dormtr.o dormqr.o dormql.o dorm2l.o
a - dsyev.o
a - dsyevd.o
a - dormtr.o
a - dormql.o
a - dormqr.o
a - dlansy.o
a - dsytrd.o
a - dorgtr.o
a - dsteqr.o
a - dsterf.o
a - dlascl.o
a - dlamch.o
a - ilaenv.o
a - dlassq.o
a - dsytd2.o
a - dorm2l.o
a - dlatrd.o
a - dorgql.o
a - dorgqr.o
a - dlasrt.o
a - dlaset.o
a - dlanst.o
a - dlaev2.o
a - dlasr.o
a - dlapy2.o
a - dlartg.o
a - dlae2.o
a - dorg2r.o
a - dlarft.o
a - dlarfb.o
a - dorg2l.o
a - dlarfg.o
a - dlarf.o
a - dspev.o
a - dlansp.o
a - dsptrd.o
a - dopgtr.o
a - dposv.o
a - dppsv.o
a - dspsv.o
a - dgeev.o
a - dsptrs.o
a - dsptrf.o
a - dpptrs.o
a - dpptrf.o
a - dgebak.o
a - dtrevc.o
a - dlacpy.o
a - dhseqr.o
a - dorghr.o
a - dgehrd.o
a - dgebal.o
a - dlange.o
a - dlabad.o
a - dlahqr.o
a - dlarfx.o
a - dlanhs.o
a - dlaln2.o
a - dgehd2.o
a - dlahrd.o
a - dlanv2.o
a - dladiv.o
a - dgerq2.o
a - dorm2r.o
a - dlarnv.o
a - dgeqr2.o
a - dlaruv.o
a - dspevd.o
a - dstedc.o
a - dopmtr.o
a - dlaed0.o
a - dlaed1.o
a - dlaed7.o
a - dlaeda.o
a - dlaed8.o
a - dlaed9.o
a - dlamrg.o
a - dlaed2.o
a - dlaed3.o
a - dsygv.o
a - dsygst.o
a - dsygs2.o
a - dlaed4.o
a - dlaed5.o
a - dlaed6.o
a - dpotrf.o
a - dpotrs.o
a - dpotf2.o
a - ieeeck.o
a - dsyevd.o
a - dormtr.o
a - dormqr.o
a - dormql.o
a - dorm2l.o
ranlib lapack.a
mv lapack.a /usr/local/amber10/lib
(cd cblas && make install )
ar rv blas.a dasum.o daxpy.o dcopy.o ddot.o  dgbmv.o dgemm.o dgemv.o dger.o dnrm2.o drot.o  drotg.o dsbmv.o dscal.o dspmv.o dspr.o dspr2.o  dswap.o dsymm.o dsymv.o dsyr.o dsyr2.o dsyr2k.o  dsyrk.o dtbmv.o dtbsv.o dtpmv.o dtpsv.o dtrmm.o  dtrmv.o dtrsm.o dtrsv.o idamax.o lsame.o xerbla.o
a - dasum.o
a - daxpy.o
a - dcopy.o
a - ddot.o
a - dgbmv.o
a - dgemm.o
a - dgemv.o
a - dger.o
a - dnrm2.o
a - drot.o
a - drotg.o
a - dsbmv.o
a - dscal.o
a - dspmv.o
a - dspr.o
a - dspr2.o
a - dswap.o
a - dsymm.o
a - dsymv.o
a - dsyr.o
a - dsyr2.o
a - dsyr2k.o
a - dsyrk.o
a - dtbmv.o
a - dtbsv.o
a - dtpmv.o
a - dtpsv.o
a - dtrmm.o
a - dtrmv.o
a - dtrsm.o
a - dtrsv.o
a - idamax.o
a - lsame.o
a - xerbla.o
ranlib blas.a
mv blas.a /usr/local/amber10/lib
(cd f2c &&  make install  )
ar rv f2c.a abort_.o  d_atan.o  d_cosh.o  d_int.o   d_nint.o  d_sinh.o   d_abs.o   d_atn2.o  d_dim.o   d_lg10.o  d_prod.o  d_sqrt.o  exit_.o  d_acos.o  d_exp.o   d_log.o   d_sign.o  d_tan.o    d_asin.o  d_cos.o   d_mod.o   d_sin.o   d_tanh.o   wsfe.o s_cmp.o s_copy.o s_paus.o s_rnge.o s_stop.o wsle.o  xwsne.o util.o wref.o wrtfmt.o rsne.o sfe.o sue.o uio.o  open.o rdfmt.o rewind.o rsfe.o rsli.o ilnw.o inquire.o lread.o fmtlib.o  ftell_.o iio.o err.o close.o dfe.o dolio.o due.o endfile.o backspace.o  fmt.o sig_die.o pow_dd.o pow_di.o pow_ii.o lwrite.o i_len.o s_cat.o   F77_aloc.o wsne.o typesize.o
a - abort_.o
a - d_atan.o
a - d_cosh.o
a - d_int.o
a - d_nint.o
a - d_sinh.o
a - d_abs.o
a - d_atn2.o
a - d_dim.o
a - d_lg10.o
a - d_prod.o
a - d_sqrt.o
a - exit_.o
a - d_acos.o
a - d_exp.o
a - d_log.o
a - d_sign.o
a - d_tan.o
a - d_asin.o
a - d_cos.o
a - d_mod.o
a - d_sin.o
a - d_tanh.o
a - wsfe.o
a - s_cmp.o
a - s_copy.o
a - s_paus.o
a - s_rnge.o
a - s_stop.o
a - wsle.o
a - xwsne.o
a - util.o
a - wref.o
a - wrtfmt.o
a - rsne.o
a - sfe.o
a - sue.o
a - uio.o
a - open.o
a - rdfmt.o
a - rewind.o
a - rsfe.o
a - rsli.o
a - ilnw.o
a - inquire.o
a - lread.o
a - fmtlib.o
a - ftell_.o
a - iio.o
a - err.o
a - close.o
a - dfe.o
a - dolio.o
a - due.o
a - endfile.o
a - backspace.o
a - fmt.o
a - sig_die.o
a - pow_dd.o
a - pow_di.o
a - pow_ii.o
a - lwrite.o
a - i_len.o
a - s_cat.o
a - F77_aloc.o
a - wsne.o
a - typesize.o
ranlib f2c.a
mv f2c.a /usr/local/amber10/lib
(cd c9x-complex && make skip )
using built-in (C99) complex.h functionality
(cd cifparse && make install )
lex -t cifparse.l | sed 's/yy/cifp/g' > lex.cif.c
/usr/local/amber10/bin/yacc -v -d cifparse.y
sed 's/yy/cifp/g' < y.tab.c > cifp.tab.c
sed 's/yy/cifp/g' < y.tab.h > cifp.tab.h
rm y.tab.c y.tab.h
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   lex.cif.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -Dlex cifp.tab.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   cifparse.c
rm -f cifparse.a
ar rv cifparse.a lex.cif.o  cifp.tab.o  cifparse.o
a - lex.cif.o
a - cifp.tab.o
a - cifparse.o
ranlib cifparse.a
mv cifparse.a /usr/local/amber10/lib
(cd nab && make install )
cc  -DBINDIR='"."' -DINCDIR='"."' -DLIBDIR='"."'  -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   \
	-DCC='"cc"' -DCPP='"/usr/local/amber10/bin/ucpp -l"' -DFLIBS='"/usr/local/amber10/lib/libsym.a /usr/local/amber10/lib/arpack.a /usr/local/amber10/lib/f2c.a   /usr/local/amber10/lib/blas.a /usr/local/amber10/lib/lapack.a /usr/local/amber10/lib/blas.a /usr/local/amber10/lib/f2c.a -lsunmath -lm"' -o nab nab.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o nab2c.o nab2c.c
/usr/local/amber10/bin/yacc -d nabgrm.y
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o cgen.o cgen.c
(cd ../semantics; make)
cc -DDATDIR='"/usr/local/amber10/dat"' -o parse parse.c
./parse *.rules
mv ../semantics/checkexpr.c .
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o checkexpr.o checkexpr.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o dumpnode.o dumpnode.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o errormsg.o errormsg.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o fixexpr.o fixexpr.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o genavscode.o genavscode.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o node.o node.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o symbol.o symbol.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -Dlex y.tab.c
cc  -o nab2c nab2c.o	 cgen.o	 checkexpr.o	 dumpnode.o errormsg.o	 fixexpr.o	 genavscode.o	 node.o	 symbol.o	 y.tab.o
./nab  -c  allatom_to_dna3.nab
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o axis2frame.o axis2frame.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o binpos.o binpos.c
cc -c -fnostd -O -DSUN -DSYSV -DBINTRAJ    bonded_atoms.c
cc -c -fnostd -O -DSUN -DSYSV -DBINTRAJ    -DDATDIR='"/usr/local/amber10/dat"' boundsutil.c
./nab  -c  lmod.nab
./nab  -c  xmin.nab
cc -c -fnostd -O -DSUN -DSYSV -DBINTRAJ    conjgrad.c
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o database.o database.c
./nab  -c  dna3.nab
./nab  -c  dna3_to_allatom.nab
cc -c -fnostd -DSYSV -DBINTRAJ   -o dump.o dump.c
cc -c -fnostd -O -DSUN -DSYSV -DBINTRAJ    -Dlex embed.c
*** Error code 2
make: Fatal error: Command failed for target `embed.o'
Current working directory /usr/local/amber10/src/nab
*** Error code 1
make: Fatal error: Command failed for target `install'